Au 1er octobre 2026, la situation des petits cours d’eau reste exceptionnellement dégradée en France. Selon les observations du réseau ONDE de l’Office français de la biodiversité, 1 594 cours d’eau de tête de bassin versant présentent des ruptures d’écoulement ou sont totalement à sec, soit quasiment la moitié des sites observés.
Il s’agit du niveau le plus élevé enregistré en 15 ans de suivi, tous mois confondus. Fait particulièrement marquant, la situation a continué de se détériorer en septembre, alors que cette période marque habituellement une stabilisation, voire une amélioration après l’été. Ceci est lié au déficit pluviométrique particulièrement marqué durant le mois, qui est de 66 % à l'échelle nationale, ce qui en fait le troisième mois de septembre le moins arrosé depuis le début des relevés.
Dans certains secteurs, les assecs persistent depuis plus de quatre mois. Le niveau est même supérieur à celui de l’été 2022, avec environ 200 cours d’eau supplémentaires touchés.
Une sécheresse historique qui persiste et se prolongeToutes les régions sont concernées, mais la situation reste particulièrement critique sur un axe allant de la Vendée au Grand Est. Une aggravation est également observée en Occitanie et en Auvergne-Rhône-Alpes. Cette sécheresse prolongée des petits cours d’eau peut fortement perturber les écosystèmes aquatiques, en réduisant les habitats disponibles et en fragilisant la faune et la flore.

La sécheresse n'épargne pas les grands fleuves européens
Le Rhin reste lui aussi à un niveau historiquement bas. Cette situation perturbe fortement le transport fluvial : les péniches doivent réduire leur chargement, certains convois deviennent difficiles voire impossibles sur les secteurs les plus peu profonds. Les conséquences sont également visibles sur les écosystèmes, l’agriculture et localement la salinisation des eaux.
La sécheresse devrait se prolonger en France, surtout dans le nord du pays, où le maintien de conditions anticycloniques pourrait limiter fortement les précipitations jusqu’à la fin du mois.